Село Маковцы упоминается уже в конце XVI столетия. Оно относилось тогда к Вепрейской волости Боровского уезда. На протяжении нескольких веков селом владели представители дворянского рода Головиных. В песцовых книгах отмечено как «старинная вотчина» Алексея Ивановича Головина. В начале XIX века владельцами имения стали дворяне Победоносцевы, затем — помещики Панютины.
На начало 1780-х годов, согласно «Описаниям и алфавитам к Калужскому атласу» после 1776 г. вошедшими в состав Медынского уезда селом Маковцы владели Иван Сергеевич, Василий Васильевич Головины.
С 1785 года начинается история храма в Маковцах. Здесь, благодаря поручику Фёдору Васильевичу Головину, построили деревянную церковь. Постепенно она обветшала и, вероятно, стала непригодной для Богослужений. Казанскую церковь возвели на деньги прихожан в 1869 году на месте прежней, деревянной. Церковь имела три престола: во имя Казанской иконы Божией Матери, святых благоверных князей Бориса и Глеба и святой великомученицы Параскевы. В штате были священник, диакон и псаломщик. Церковь была выстроена в стиле классицизма вместо прежней деревянной недалеко от святого источника. Церковь служила прихожанам чуть более полувека. Но с приходом советской власти храм закрыли, разорив до основания при этом внутренне убранство. Во время Великой Отечественной войны Церковь Казанской иконы Божией Матери в Маковцах сильно пострадала. Сохранились лишь руины от нее.
В течении двух столетий владельцы менялись трижды, но усадьба по-прежнему оставалась одной из самых приметных и ухоженных в этом районе. Окружал усадьбу липовый парк.
Сохранились руинированная Казанская церковь 1869 г. в стиле классицизма (от колокольни остался нижний ярус), построенная вместо прежней деревянной, и фрагменты регулярного липового парка; около церкви много старых заброшенных надгробий (из них отец Исидор был погребён за алтарём, рядом с ним похоронена и его матушка).
Сейчас ведутся работы по восстановлению храма.
